Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME3Q16798 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME3Q16798 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME3Q16798 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME3Q16798 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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