Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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CRY1Q16526 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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CRY1Q16526 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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CRY1Q16526 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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CRY1Q16526 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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CRY1Q16526 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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