Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRQ13535 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATRQ13535 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATRQ13535 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATRQ13535 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATRQ13535 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ATRQ13535 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ATRQ13535 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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