Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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