Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAPQ12770 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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