Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms