Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBQ06643 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LTBQ06643 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBQ06643 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms