Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2NP61088 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms