Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms