Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF1P18846 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF1P18846 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF1P18846 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms