Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APAF1O14727 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APAF1O14727 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APAF1O14727 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APAF1O14727 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APAF1O14727 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms