Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
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