Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms