Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CEP164Q9UPV0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CEP164Q9UPV0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CEP164Q9UPV0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP164Q9UPV0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms