Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPMQ9NSP4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms