Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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