Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC2Q9C0B9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms