Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms