Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOLD1Q96LR9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOLD1Q96LR9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms