Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 WAC-213ENST00000472862 2229 ntTSL 28.71□□□□□ -1.022e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-205ENST00000403712 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.022e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TOX3-203ENST00000563091 572 ntTSL 48.55□□□□□ -1.044e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.062e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 CRADD-211ENST00000552983 839 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 CRADD-206ENST00000549615 514 ntTSL 38.43□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-215ENST00000555098 618 ntTSL 48.41□□□□□ -1.062e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PRKAA1-206ENST00000506652 1082 ntTSL 58.29□□□□□ -1.082e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.092e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-220ENST00000556896 571 ntTSL 48.19□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-215ENST00000468321 2739 ntTSL 1 (best)8.12□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C2orf74-206ENST00000489686 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.1□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.142e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 AP001347.1-202ENST00000432621 1084 ntTSL 1 (best)7.83□□□□□ -1.162e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-219ENST00000556812 331 ntTSL 57.8□□□□□ -1.162e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.162e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C2orf74-202ENST00000426997 879 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.162e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PRKCA-204ENST00000583361 519 ntTSL 37.76□□□□□ -1.172e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 CCDC102B-207ENST00000581520 465 ntTSL 37.73□□□□□ -1.172e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TTC28-AS1-220ENST00000454996 837 ntTSL 27.34□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 STAG1-208ENST00000487065 2914 ntTSL 1 (best)7.32□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-214ENST00000465733 551 ntTSL 47.26□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-218ENST00000472861 441 ntTSL 37.26□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 OSBPL10-206ENST00000463504 533 ntTSL 47.25□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 BBX-202ENST00000402163 1586 ntTSL 57.22□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 MYO1E-203ENST00000558571 557 ntTSL 57.22□□□□□ -1.254e-12■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 FANCC-204ENST00000433829 591 ntTSL 37.2□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.264e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 CCDC102B-204ENST00000578970 537 ntTSL 46.94□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 FMNL2-203ENST00000492942 753 ntTSL 36.93□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.312e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 VAMP7-205ENST00000479687 742 ntTSL 56.74□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 OSBPL10-207ENST00000465626 473 ntTSL 26.66□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TCF12-224ENST00000561346 852 ntTSL 26.62□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 RPN2-205ENST00000456102 791 ntTSL 36.55□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ARPC4-TTLL3-204ENST00000453882 499 ntTSL 46.51□□□□□ -1.372e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-208ENST00000553316 572 ntTSL 46.47□□□□□ -1.372e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 BBX-225ENST00000485939 555 ntTSL 46.06□□□□□ -1.442e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PRPSAP1-209ENST00000494662 572 ntTSL 26.03□□□□□ -1.442e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-212ENST00000462719 569 ntTSL 45.76□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-207ENST00000415368 494 ntTSL 35.64□□□□□ -1.512e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.512e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.544e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.552e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-211ENST00000585363 241 ntTSL 55.39□□□□□ -1.558e-7■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.552e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 DOCK5-209ENST00000481728 780 ntTSL 55.37□□□□□ -1.552e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 VAMP7-204ENST00000463317 673 ntTSL 55.33□□□□□ -1.562e-8■■■■■ 39.2
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TBRG4Q969Z0 C14orf93-209ENST00000553606 467 ntTSL 45.14□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.614e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.612e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TAF1-219ENST00000492404 1249 ntTSL 54.97□□□□□ -1.612e-8■■■■■ 39.2
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TBRG4Q969Z0 PRKAA1-207ENST00000509874 692 ntTSL 44.93□□□□□ -1.622e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-236ENST00000592846 484 ntTSL 44.82□□□□□ -1.649e-7■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TDG-207ENST00000542926 1277 ntTSL 54.77□□□□□ -1.652e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 BBX-218ENST00000456817 581 ntTSL 34.76□□□□□ -1.652e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.662e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.672e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.692e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 FANCC-212ENST00000636777 652 ntTSL 54.41□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 BBX-209ENST00000427402 959 ntTSL 54.24□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 OSBPL10-214ENST00000479173 554 ntTSL 44.23□□□□□ -1.733e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.762e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 QTRT2-206ENST00000466870 522 ntTSL 33.77□□□□□ -1.812e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 BBX-221ENST00000458458 513 ntTSL 43.66□□□□□ -1.822e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 HIF1A-210ENST00000557206 767 ntTSL 33.12□□□□□ -1.912e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 QTRT2-210ENST00000482307 449 ntTSL 53.01□□□□□ -1.932e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 FANCC-207ENST00000474949 841 ntTSL 53□□□□□ -1.932e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.952e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.972e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-213ENST00000554179 441 ntTSL 42.68□□□□□ -1.982e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.052e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-222ENST00000588494 505 ntTSL 42.03□□□□□ -2.081e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SC5D-206ENST00000528991 346 ntTSL 31.9□□□□□ -2.112e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.22e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.292e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 39.1
TBRG4Q969Z0 TOP3A-217ENST00000584582 3661 ntTSL 511.36□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 39
TBRG4Q969Z0 TOP3A-201ENST00000321105 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 39
TBRG4Q969Z0 TOP3A-208ENST00000542570 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 39
TBRG4Q969Z0 TOP3A-209ENST00000580095 2929 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 39
TBRG4Q969Z0 TOP3A-214ENST00000582981 3239 ntTSL 210.26□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 39
TBRG4Q969Z0 TOP3A-203ENST00000469739 3196 ntTSL 29.26□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 39
TBRG4Q969Z0 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.234e-13■■■■■ 39
TBRG4Q969Z0 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.664e-13■■■■■ 39
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