Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP13Q86W25 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms