Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRAIDQ6UW56 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms