Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms