Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms