Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms