Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI66

KRTAP6-2, Keratin-associated protein 6-2, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP6-2Q3LI66 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
KRTAP6-2Q3LI66 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms