Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms