Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDB1Q16531 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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