Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SF1Q15637 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SF1Q15637 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SF1Q15637 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SF1Q15637 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SF1Q15637 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SF1Q15637 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SF1Q15637 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms