Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms