Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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