Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.42e-88■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.066e-36■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.266e-36■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.741e-13■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.122e-60■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 RPL17-201ENST00000578528 481 ntTSL 327.28■■□□□ 1.961e-6■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 RPL17-206ENST00000579495 914 ntTSL 223.96■■□□□ 1.431e-6■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 SDHB-204ENST00000475049 397 ntTSL 35.91□□□□□ -1.462e-9■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.956e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.346e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 EXOSC5-205ENST00000602129 354 ntTSL 516.22■□□□□ 0.196e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 PHF20-216ENST00000617560 618 ntTSL 216.55■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PHF20-201ENST00000339089 1997 ntTSL 215.08■□□□□ 01e-6■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.141e-6■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.186e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.156e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.146e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SUMF2-209ENST00000436782 1683 ntTSL 1 (best)19.03■□□□□ 0.646e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 SUMF2-211ENST00000438133 1771 ntTSL 1 (best)14.8□□□□□ -0.046e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.92e-6■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.398e-8■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.628e-8■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.458e-8■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.912e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 GTPBP3-217ENST00000598493 808 ntTSL 525.15■■□□□ 1.624e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 GTPBP3-212ENST00000596125 644 ntTSL 224.5■■□□□ 1.514e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.54e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.414e-10■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.284e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 RHEBL1-204ENST00000550797 1261 ntTSL 1 (best)22.68■■□□□ 1.224e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 GTPBP3-205ENST00000594018 934 ntTSL 522.51■■□□□ 1.194e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 STX10-210ENST00000591843 1073 ntTSL 521.52■■□□□ 1.042e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SIRT6-209ENST00000599365 1372 ntTSL 1 (best)21.13■□□□□ 0.974e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.914e-13■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PPT2-EGFL8-204ENST00000453656 1327 ntTSL 220.64■□□□□ 0.894e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.894e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.882e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PPT2-EGFL8-206ENST00000583227 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.52■□□□□ 0.874e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SIRT6-212ENST00000600938 1473 ntTSL 220.3■□□□□ 0.844e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.822e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.824e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.794e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.782e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.784e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.774e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.774e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 COMMD5-205ENST00000530332 1329 ntTSL 219.76■□□□□ 0.754e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.744e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.744e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.674e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.674e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.664e-10■■■□□ 17.1
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