Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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