Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms