Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OC90Q02509 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OC90Q02509 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OC90Q02509 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OC90Q02509 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OC90Q02509 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OC90Q02509 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OC90Q02509 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OC90Q02509 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OC90Q02509 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OC90Q02509 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OC90Q02509 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms