Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS28P62857 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS28P62857 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS28P62857 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms