Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms