Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCE1P61221 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms