Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCBP3P57721 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCBP3P57721 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCBP3P57721 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCBP3P57721 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCBP3P57721 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCBP3P57721 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCBP3P57721 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms