Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPD2P43304 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPD2P43304 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GPD2P43304 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPD2P43304 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPD2P43304 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPD2P43304 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPD2P43304 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPD2P43304 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPD2P43304 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GPD2P43304 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPD2P43304 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPD2P43304 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPD2P43304 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPD2P43304 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPD2P43304 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPD2P43304 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms