Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGDSP41222 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms