Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VARSP26640 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VARSP26640 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VARSP26640 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VARSP26640 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VARSP26640 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VARSP26640 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VARSP26640 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VARSP26640 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VARSP26640 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VARSP26640 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VARSP26640 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VARSP26640 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VARSP26640 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VARSP26640 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VARSP26640 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VARSP26640 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms