Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms