Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3BP20337 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms