Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODC1P11926 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODC1P11926 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ODC1P11926 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ODC1P11926 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ODC1P11926 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ODC1P11926 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ODC1P11926 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ODC1P11926 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ODC1P11926 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ODC1P11926 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ODC1P11926 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ODC1P11926 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms