Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSO75390 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSO75390 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSO75390 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms