Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLGNO14967 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLGNO14967 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLGNO14967 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms