Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KRW8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KRW8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KRW8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KRW8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KRW8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KRW8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KRW8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KRW8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KRW8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KRW8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KRW8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KRW8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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