Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms