Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q9UJK0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms